Odpady medyczne zakwalifikowane do kodu 18 01 03* powinny być transportowane z zachowaniem przepisów obowiązujących przy transporcie towarów niebezpiecznych. Najważniejsze jest, aby odpady zostały tak opakowane, aby podczas transportu nie doszło do uwolnienia ich zawartości na zewnątrz. Opakowanie zewnętrzne powinno zostać oznakowane w widoczny sposób tak, aby było możliwe zidentyfikowanie zawartości opakowania.
Odpady medyczne powinny być zabezpieczone w transportowe pojemniki zamykane. Pojemniki transportowe po wyładowaniu odpadów powinny zostać umyte i w razie potrzeby zdezynfekowane. Kluczowym aspektem jest zapewnienie bezpiecznego transportu niebezpiecznych odpadów medycznych. Transport środkami komunikacji publicznej nie powinien mieć miejsca z uwagi na ryzyko narażenia na skażenie biologiczne ludzi i środowiska.
